DNA配列と凝集、エントロピー

virus causes diseases

distinct pathogens, diverse symptoms.

 

viral reservoir (ODE的にはコンパートメント)

autoimmunity (ODE的には抑制化は負の増殖制御)

tissue damage and dysfunctions (空間的変化とそれに付随する関数の変化)

latent virus reactivation (時間遅れ)

 

https://www.bloomberg.com/opinion/articles/2024-02-20/retirement-if-you-couldn-t-have-a-401-k-how-would-you-save

 

 

 

 

DNA配列からタンパク質の折りたたみ構造について、

連続していないモノマー同士の結合数をS

連結することの出来る自由な部分の数をAとする。

すると、評価指標としては、 F = S - \alpha A

とする。

 

www.ncbi.nlm.nih.gov

 

確率的DNA配列を変化させた時に(つまりDNAに変異が入った時に)先ほどの指標がどう変化するかを調べて、その指標の増減に応じてそのDNA配列の割合を変化させる。

すると、自然界で起きているDNAの分布の時間発展が再現できそう。

 

 

H-クラスタリングなることをしている。